Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pgpep1lQ9CWB5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pgpep1lQ9CWB5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms