Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms