Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms