Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms