Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms