Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dis3Q9CSH3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dis3Q9CSH3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms