Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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