Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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