Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms