Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms