Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otub2Q9CQX0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otub2Q9CQX0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms