Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms