Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms