Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms