Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms