Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms