Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms