Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms