Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rab5aQ9CQD1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rab5aQ9CQD1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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