Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CQC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms