Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms