Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
StambpQ9CQ26 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms