Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nsmce3Q9CPR8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms