Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sike1Q9CPR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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