Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt88Q9CPR6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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