Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox6cQ9CPQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms