Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc4Q99PH1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc4Q99PH1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms