Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms