Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms