Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms