Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms