Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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