Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca3Q99M54 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca3Q99M54 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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