Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms