Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms