Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms