Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlgn1Q99K10 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms