Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1bQ99JY6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms