Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lims1Q99JW4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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