Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxp3Q99JB6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms