Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf112Q96DY5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms