Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf144aQ925F3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf144aQ925F3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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