Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim59Q922Y2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms