Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms