Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Odf3Q920N1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Odf3Q920N1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf3Q920N1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Odf3Q920N1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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