Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms