Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhb12Q91Y07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms