Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms