Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac11Q91WA3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms