Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx9Q91VH2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms